Filogenia y resistencia de cepas de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido a los antibióticos en pacientes con cáncer hospitalizados en Perú / Phylogeny and antimicrobial resistance of extended-spectrum beta-lactamase- producing Escherichia coli from hospitalized oncology patients in Perú

Introducción. Las infecciones asociadas con la atención en salud constituyen un problema de salud pública porque aumentan la morbimortalidad de los pacientes, sobre todo de aquellos con factores de riesgo, como la inmunosupresión debida a enfermedades oncológicas. Es importante conocer la diversidad genética de los principales microorganimos causantes de infecciones hospitalarias mediante la vigilancia epidemiológica tradicional y la epidemiología molecular, para hacer un mejor seguimiento y detectar brotes tempranamente. Objetivo. Determinar el grupo filogenético y la resistencia a antibióticos de las cepas de Escherichia coli aisladas de pacientes con cáncer hospitalizados. Materiales y métodos. Se hizo un estudio de tipo transversal que incluyó 67 cepas de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Se determinó el grupo filogenético, el perfil de resistencia a los antibióticos, los genes de resistencia a betalactámicos, el tipo de las muestras y los servicios de hospitalización de donde fueron recuperadas. Resultados. El grupo filogenético más frecuente fue el B2 (36 %). El 57 % de las cepas B2 fueron aisladas de muestras de orina y el 33 % provenía del servicio de urología. La resistencia a ciprofloxacino y gentamicina fue de 91 y 53 %, respectivamente, y el 79 % de las cepas tenía el gen blaCTX-M. Se encontró una relación significativa (p<0,05) entre los grupos filogenéticos y la resistencia a ciprofloxacina, así como a la edad del paciente. Conclusión. El filogrupo de E. coli predominante fue el B2. Se evidenció una gran resistencia a ciprofloxacina y gentamicina, una proporción elevada de cepas BLEE con el blaCTX-M, y una relación entre el grupo filogenético y la resistencia a ciprofloxacino.

Introduction: Healthcare-associated infections are a public health problem due to the increased morbimortality of patients, especially those with risk factors such as immunosuppression due to oncological diseases. It is essential to determine the genetic diversity of the main microorganisms causing healthcare infections by combining traditional epidemiological surveillance and molecular epidemiology for better outbreak follow-up and early detection. Objective: To determine the phylogenetic group and antibiotic resistance of Escherichia coliisolated from hospitalized oncologic patients. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study of 67 strains of ESBL-producing Escherichia coli to determine their phylogenetic group and described their antibiotic resistance profile, beta-lactam resistance genes, as well as the type of sample and the hospitalization areas from which they were recovered. Results: The most frequent phylogenetic group was B2 (36%); 57% of B2 strains were isolated from urine and 33% came from the urology department. Resistance to ciprofloxacin and gentamicin was 92% and 53%, respectively, and 79% of the strains had the blaCTX-Mgene. A significant association (p<0.05) was found between the phylogenetic groups, ciprofloxacin resistance, and the age of the patients. Conclusion: The predominant E. coli phylogroup was B2. We evidenced high resistance to ciprofloxacin and gentamicin, a high proportion of ESBL strains with the blaCTX-M gene, and a significant association between the phylogenetic group and the resistance to ciprofloxacin.

Caracterización molecular de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae / Molecular characterization of virulence (lmb, bca and rib) and macrolid resistance genes (ermB, ermTR and mefA) in clinical isolates of Streptococcus agalactiae

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente los genes de virulencia y resistencia a macrólidos en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae (EGB), recuperados en 2019 a partir de secreción vaginal (n=9) y orina (n=22), en dos establecimientos de salud de Lima. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2, se confirmó la identificación fenotípicamente; la resistencia a macrólidos por el método D-test; la identificación de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El fenotipo y genotipo de resistencia a macrólidos predominante fue cMLSb (12/31) y ermB (11/31), y el gen de virulencia más frecuente fue lmb (23/31). Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina. Estos hallazgos muestran la necesidad de implementar estudios de epidemiología molecular que permitan un adecuado conocimiento y seguimiento de EGB en el Perú.

ABSTRACT The aim of the study was to molecularly identify virulence and macrolide resistance genes in clinical isolates of Streptococcus agalactiae (GBS), recovered in 2019 from vaginal discharge (n=9) and urine (n=22), from two health facilities in Lima. Identification and antimicrobial susceptibility were determined by the Vitek® 2 automated system, identification was confirmed phenotypically; macrolide resistance was determined by the D-test method. Identification of virulence genes (lmb, bca and rib) and macrolide resistance genes (ermB, ermTR and mefA) was carried out by polymerase chain reaction (PCR). The predominant macrolide resistance phenotype and genotype were cMLSb (12/31) and ermB (11/31); the most frequent virulence gene was lmb (23/31). All were sensitive to penicillin, ampicillin and vancomycin. These findings show the need to implement molecular epidemiology studies that allow adequate knowledge and follow-up of GBS in Peru.

Presencia de genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productora de betalactamasas de espectro extendido en Lima, Perú / Presence of fimH and afa genes in urinary isolates of extended-spectrum beta-lactamases producing Escherichia coli in Lima, Peru

RESUMEN Con el objetivo de determinar la presencia de los genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE), se realizó un estudio descriptivo, con aislamientos del cepario del proyecto TO-06/09 del Instituto Nacional de Salud del Niño en Lima, Perú. Se incluyeron 75 aislamientos urinarios de Escherichia coli. La identificación de genes se realizó por reacción en cadena de la polimerasa. De los 75 aislamientos, 74 (98,7%) fueron positivos para el gen fimH y 6 (8,0%) fueron positivos para el gen afa. Se evidenció la presencia de los factores de virulencia producidos por los genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productoras de BLEE.

ABSTRACT Descriptive study conducted in order to determine the presence of the fimH and afa genes in urinary isolates of extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) producing Escherichia coli. Isolates from project TO-06/09 of the Instituto Nacional de Salud del Niño in Lima, Peru were used. A total of 75 urinary isolates of Escherichia coli were included. Gene identification was performed by polymerase chain reaction. From the 75 isolates, 74 (98.7%) were positive for the fimH gene and 6 (8.0%) were positive for the afa gene. Virulence factors produced by the fimH and afa genes were evident in urinary isolates of ESBL producing Escherichia coli.

Aislamiento de Candida albicans de hisopado nasal y faríngeo en alumnos de secundaria / Isolation of Candida albicans from high school students' nasal and throat samples

Introducción: Candida sp puede encontrarse como comensal en equilibrio en la cavidad bucal humana; pero, en la población pediátrica y adolescente con un sistema inmune inmaduro las condiciones de la levadura se tornarían favorables para su patogenia. Objetivo: Determinar la presencia de Candida albicans en secreción faríngea y nasal en alumnos de educación secundaria. Diseño: Estudio descriptivo transversal. Lugar: Instituto de Medicina Tropical, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Participantes: Alumnos del 4to (52) y 5to (50) años de secundaria. Intervenciones: En octubre del 2007, las muestras nasales y faríngeas de 102 estudiantes de 14 a 17 años fueron colectadas en medios de transporte y luego cultivadas en los laboratorios del Instituto de Medicina Tropical, en agar sabouraud y CHROMOagar Candida. Se identificó las colonias sospechosas de Candida sp mediante el estudio de clamiodoconidias, tubo germinativo y pruebas metabólicas. Principales medidas de resultados: Identificación de levaduras de Candida sp. Resultados: Se aisló levaduras del género Candida en 11 de los escolares (10,8 por ciento). El 36,4 por ciento de las levaduras presentó resistencia moderada al antimicótico fluconazol. Conclusiones: Es recomendable continuar con estudios de vigilancia epidemiológica sobre las levaduras de importancia médica en portadores nasofaríngeos, con el fin estar preparados ante eventuales cuadros infecciosos...

Objective: To determine the presence of Candida albicans in throat and nasal secretion in high school students. Design: Cross-sectional study. Setting: Institute of Tropical Medicine, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Peru. Participants: High school students from San Juan Macias School in Santa Anita, Lima, Peru. Interventions: Nasal and throat samples were collected from 102 14-17 year-old students. Samples were grown on sabouraud agar and Candida CHROMOagar and identified by chlamydospores study and metabolic tests. Main outcome measures: Identification of C. albicans yeast. Results: Candida yeast was isolated from 11 students (10.8 per cent). A significant percentage of yeast (36.4 per cent) developed moderate resistance to fluconazole. Conclusions: Continuous surveillance of medically important yeasts in nasopharyngeal carriers is suggested in order to be prepared for eventual infectious conditions...

Estudio microbiológico y anatomopatológico de bronquiectasias sangrantes en piezas de resección pulmonar / Microbiological and pathological study of leeding bronchiectasis removed by pulmonary resection

La hemoptisis periódica o recurrente en los pacientes con bronquiectasias sangrantes, secuelas de tuberculosis pulmonar, sigue siendo un factor de alto riesgo de muerte, por el desconocimiento de la comunidad médica de que existen otros agentes oportunistas que producen el sangrado, ajenos a la tuberculosis pulmonar. Determinar los verdaderos agentes causales de la infección de las bronquiectasias sangrantes. Determinar las causas del sangrado que puede ser mortal. Se han estudiado las piezas operatorias de 24 pacientes con hemoptisis por bronquiectasias sangrantes por secuelas de tuberculosis pulmonar, a quienes se le ha realizado previamente los siguientes estudios: radiografía de tórax standard y tomografía axial computarizada, examen directo y cultivo de BK, broncofibroscopia para observación directa de lesiones intraluminales sangrantes, y para determinar el nivel del sangrado con el fin de que el paciente sea sometido a cirugía para la extirpación del segmento o lóbulo sangrante. Los hallazgos del acto operatorio, han sido tomados en cuenta y las piezas operatorias han sido sometidas a un estudio anatomo-patológico y microbiológico en búsquedade hongos, tuberculosis, gérmenes comunes y neoplasia pulmonar. Se demostró la presencia del hongo Aspergillus en el 83,3% de los casos de pacientes con bronquiectasias o cavernas; el estudio de gérmenes comunes aerobios y de tuberculosis, concomitante, fue negativo en el 100% de los casos. El reporte operatorio y el estudio anatomo patológico, demuestran la presencia de micetoma y lesiones cicatriciales altamente sangrantes que hacen un acto operatorio de tiempo prolongado...

Periodical bleeding in patients with bronchiectasia, sequel of lung tuberculosis, carries a high death risk due to the fact that the medical community is not aware that other opportunistic agents, apart from tuberculosis, can produce hemorrhages. To establish the pathogenic agents of the infection in bleeding bronchiectasia from samples obtained through surgical resection. We have studied the surgical specimens obtained from 24 patients with bleeding bronchiectasia. Before operation the patients were subjected to standard radiological and computerized tomography of the lungs, directed sputum examination and culture for mycobacterium tuberculosis, as well as fiber optic bronchoscope to observe the bleeding intraluminary lesions and to establish the level of the hemorrhage, so that the patient may be operated expend to remove the bleeding segment or lobe. The surgical specimens were examined pathologically and microbiologically to detect tuberculosis, fungi, common bacteria and neoplasia. Aspergillum was found in 83.3% of the bronchiectasia or caverns. The investigation of common aerobic microbes and mycobacterium tuberculosis was negative in 100% of the specimens. Mycetoma and highly weeding ears were documented by the surgical report and pathological examination. These bleeding lesions required prolonged operative procedures. In bleeding bronchiectasia the only infective agent found was Aspergillum. There was not concomitant tuberculosis or other pathogenic agents. The invaded scar tissue was highly vascularizado causing moderate to severe bleeding, a death risk for patients.

Efecto protector de una vacuna recombinante contra la hepatitis B siguiendo tres esquemas de inmunización. Lima - Perú 2004 / Protective effect of a recombinant vaccine against hepatitis B following three immunization schema

Objetivo: Demostrar que el efecto protector contra la hepatitis B en estudiantes del área de ciencias de la salud susceptibles se logra igualmente luego de completar tres esquemas de vacunación, uno convencional y dos acortados en tiempo y dosis. Diseño: Estudio experimental, controlado, abierto y con asignación aleatoria de grupo. Materiales y Métodos: Participaron 89 alumnos del último año de estudios (internado) de la Escuela Académico Profesional de Tecnología Médica, Facultad de Medicina, UNMSM, de ambos sexos y menores de 30 años, a quienes se asignó aleatoriamente a tres grupos de receptores de la vacuna, siguiendo uno de tres esquemas de vacunación: el convencional de tres dosis (0, 1 y 6 meses) , el acortado de tres dosis (0, 1 y 2 meses) y acortado de dos dosis (0 y 1 mes). Se excluyó los vacunados contra hepatitis B y aquellos que fueron positivos a marcadores de antígeno de superficie (HBsAg) o anti core total (anti-HBc IgG). Según el cronograma establecido, se administró las dosis de vacuna recombinante contra virus de hepatitis B (REVAC-B) en concentraciones de 20 mcg/mL y se tomó muestras de sangre para la titulación de anticuerpos. Resultados: La edad promedio de los 89 alumnos fue 23,5 años, siendo 51,7 por ciento (46) del sexo masculino y 48,3 por ciento (43) del femenino. A los 30 días de la primera dosis, el 12,4 por ciento alcanzó protección, a los 30 días posterior a la segunda dosis, 98,8 por ciento , y a los 180 días, hubo 100 por ciento de protección. Conclusiones: En el presente estudio se obtuvo igual efecto protector contra la hepatitis B mediante la administración de la vacuna con tres esquemas diferentes: esquema convencional (tres dosis), esquema acortado (dos dosis) y esquema acortado (tres dosis). Se plantea la posibilidad de un esquema con dos dosis, el cual tendría un menor costo e igual beneficio.

Susceptibilidad a antimicrobianos de patógenos respiratorios en niños provenientes de la comunidad / Respiratory pathogenic microorganism's sensitivity in community children

Objetivo: Determinar la resistencia de los patógenos respiratorios a diferentes antimicrobianos. Material y métodos: Entre abril y noviembre de 2002 se estudió 177 pacientes que asistieron al consultorio externo de otorrinolaringología del Hospital Nacional Docente Madre Niño San Bartolomé. Resultados: Streptococcus pneumoniae fue la bacteria patógena más aislada (57,2 por ciento), luego Moraxella catarrhalis (42,7 por ciento), Staphylococcus aureus (18,6 por ciento) y en pequeña cantidad Haemophilus influenzae (3,4 por ciento) y Streptococcus pyogenes (0,7 por ciento). Streptococcus pneumoniae presentó 31,3 por ciento de resistencia a la penicilina. El 96,7 por ciento de Moraxella catarrhalis fueron productoras de betalactamasa y 7,4 por ciento de los Staphylococcus aureus fueron resistentes a la oxacilina. Conclusión: Streptococcus pneumoniae es el principal agente causal de los procesos infecciosos altos en niños y su resistencia a la penicilina aumentó a 31,3 por ciento.

Objective: To determine the respiratory pathogens resistance to different antimicrobial drugs. Material and methods: From April through November 2002, 177 patients attending the Mother-Child National Teaching Hospital Otorhinolaryngology outpatientÆs office were studied. Results: Streptococcus pneumoniae was the most frequently isolated pathogenic bacteria (57,2 per cent), followed by Moraxella catarrhalis (42,7 per cent), Staphylococcus aureus (18,6 per cent), Haemophilus influenzae (3,4 per cent) and Streptococcus pyogenes (0,7 per cent). Streptococcus pneumoniae showed resistance to the penicillin in 31,3 per cent; 96,7 of Moraxella catarrhalis were producers of betalactamase and 7,4 per cent of Staphylococcus aureus showed resistance to oxacillin. Conclusion: Streptococcus pneumoniae is the principal causal factor of respiratory infections in children and its resistance to the penicillin increased to 31,3 per cent.